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基 因 型MATahis3200trp1-901leu2-3,112ade2LYS2::(lexAop)4-HIS3ura3::(lexAop)8-lacZade2::(lexAop) 8-ADE2 GAL4簡 要 說 明DUALmembrane系統是DUALsystems BioTech公司開發的專門篩選跨膜蛋白間相互作用的檢測技術,它利用分離的泛素系統(split-ubiquitin)直接檢測天然狀態下膜蛋白間的相互作用,是目前市面上唯一檢測膜蛋白間相互作用的酵母雙雜系統。此系統采用NMY51酵母菌株,可直接轉化質粒進行蛋白互作驗證或篩庫試驗;此菌株Transformation marker為: trp1, leu2-3,報告基因為:HIS3, ADE2 和lacZ,第一步通過營養缺陷型報告基因(HIS3, ADE2)進行選擇性生長篩選,進一步通過 LacZ 報告基因進行β-半乳糖分析顯色的定量或半定量篩選,三個獨立的報告基因,受不同啟動子的調控,降低假陽性幾率。原理:泛素(ubiquitin)分子量很小,由 76aa 殘基組成;泛素作為降解信號分子,可以連接另外一種蛋白質的 N 端,然后被泛素專一性蛋白酶(UBPs)識別,從而導致與泛素相連的蛋白被酶解。泛素可以人為分成兩部分:N 端(Nub),C 端(Cub)。首先,人為地將泛素 Nub 的 3 位異亮氨酸突變為甘氨酸(NubI 突變為NubG)。這樣與 Cub 的親合力大大降低,避免了 Cub 和 Nub 自我結合或接近的可能性。其次,將Cub 部分與人工合成的 LexA-VP16 轉錄激活因子融合成一個融合蛋白Cub-LexA-VP16。正常條件下 NubG不與Cub 結合,UBPs 也不能識別分離的泛素,轉錄激活因子也不會被切下來。最后,將要檢測的蛋白質分別與NubG和Cub融合,形成 bait 融合蛋(bait-cub-LexA -VP16)和 prey 融合蛋白(prey-NubG)。如果 bait 和 prey發生相互作用,就會促使 NubG 和 Cub 的相互接近,被 UBPs 識別,導致 LexA-VP16 的解離,進入核內,從而激活報告基因的轉錄。 此系統可使用四種Bait質粒:pBT3-N,pBT3-SUC,pBT3-STE,pBT3-C,篩選標志均為LEU;三種Prey質粒:pPR3-C ,pPR3-SUC,pPR3-STE,篩選標志均為TRP。High5TM系列NMY51感受態細胞經特殊工藝制作,-80℃可保存三個月,經PGADT7質粒檢測轉化效率>104cfu/μg DNA 。操 作 說 明1.取1管感受態細胞置冰上融化,6 000 rpm離心1min,去掉上清。2.加入320 μl LiTE/PEG溶液,重懸細胞,然后加入10μl Carrier DNA(95-100 度5min 快速冰浴,重復一次),預冷目的質粒2-5ug,體積不多于20ul。3.充分混勻,于30度250 rpm轉速下培養30 min。4.42度熱激2.5min。5.6000 rpm離心1min,去掉上清。6.加入1 ml TE溶液,溫和重懸細胞。7.6000 rpm離心1min,去掉上清。8.加入100 μl TE溶液,重懸細胞,將細胞涂布于相應的營養缺陷型固體合成培養基。9.30度倒置培養48-96h,直至形成大小合適的酵母菌落。 Preparation of Media:YPDA (1L):Tryptone 20gyeast extract 10g 0.2% adenine 15ml補水到 950ml, 用鹽酸調PH到 6.5Agar 20g (for plates only)121度,15分鐘高壓滅菌,待培養基溫度降到55度時,加入已過濾的40% 葡萄糖 50 ml 0.2% adenine(1L)Adenine 2g補水到1L,溶解后高壓滅菌或0.22um濾膜過濾除菌注 意 事 項1.感受態細胞最好在冰上融化。2.轉化高濃度的質粒可相應減少最終用于涂板的菌量。3.同時轉化2-3種質粒時可增加質粒的用量。4.NMY51酵母菌株對高溫敏感,最適生長溫度為27-30℃;高于31℃,生長速度和轉化效率呈指數下降。5.酵母在缺陷培養基中生長速度比YPDA培養基慢,培養基中缺陷成分越多,生長越慢,以轉化涂板為例:涂YPDA平板29℃,48h培養可見直徑1mm克隆;涂SD單缺平板29℃,48-60h培養可見直徑1mm克隆,涂SD雙缺平板29℃,60-80h培養可見直徑1mm克隆,涂SD三缺或四缺平板平板29℃,80-90h培養可見直徑1mm克隆。
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